O Herbário ICN teve início em 1937, através da coleção de Alarich Rudolf Holger Schultz, pesquisador e professor de Botânica da Universidade do Rio Grande do Sul (UFRGS) que, inicialmente, alcançava cerca de três mil exemplares. Com a criação do Instituto de Ciências Naturais, o herbário foi integrado a este e, na década de 1970, passou a fazer parte do Departamento de Botânica do Instituto de Biociências da UFRGS.
Ao longo dos anos, o Herbário ICN foi sendo enriquecido por coleções importantes, compradas ou recebidas como doação. Entre estas, se destaca o importante acervo particular do pesquisador Karner Hagelund, com cerca de 16 mil exemplares de plantas coletadas entre as décadas de 1970 e 1980, em diversas regiões do Rio Grande do Sul que hoje são utilizadas para cultivo. Há também outras coleções notáveis, como as coletas de João Dutra e Teodoro Luis, autor da "Flora Analítica de Porto Alegre" (1960), a primeira obra sobre a flora desta região.
Com a criação do Programa de Pós-Graduação em Botânica (PPGBOT), junto ao Departamento de Botânica da UFRGS, em 1973, o Herbário ICN passou a receber as coletas de professores e alunos do PPG, como testemunho de mais de 382 dissertações e 216 teses até agora apresentadas.
O Acervo ICN tem servido de fonte de pesquisa para docentes, pesquisadores e alunos em diferentes áreas do conhecimento, destacando-se: Botânica, Ecologia, Agronomia, Genética, Farmacologia e Etnobiologia. As exsicatas, provenientes dos inúmeros projetos de pesquisa desenvolvidos nestas áreas, ficam depositadas e preservadas neste Herbário, contribuindo assim para o contínuo aumento de seu acervo.
Atualmente a coleção conta com cerca de 212.000 exemplares, em sua maioria com plantas do Rio Grande do Sul, abrangendo Angiospermas, Gimnospermas, Pteridófitas, Briófitas, Algas, Fungos e Líquens. Cerca de 83% deste acervo encontra-se informatizado em banco de dados e, aproximadamente, 26% da coleção está digitalizada, estando suas fotografias disponíveis de forma online (speciesLink e Reflora) para consultas de
pesquisadores e da comunidade em geral. O Herbário ICN mantém em seu acervo, ainda, 1.452 exsicatas de material tipo, testemunho da descrição de espécies novas para a ciência.