O Museu de Ciências Naturais está localizado no Instituto Federal do Sul de Minas Gerais Campus Machado. Este, foi inaugurado no dia 14 de novembro de 2014. O espaço tem como objetivo levar para a comunidade, interna e externa do campus, a conscientização ambiental, ressaltando a importância do equilíbrio entre fauna e flora. O museu conta com dioramas que representam biomas brasileiros e animais que neles habitam. Aberto ao público em geral, com atividades de promoção da educação ambiental e desenvolvimento de projetos pelos alunos do curso de Licenciatura em Ciências Biológicas do campus Machado do IFSULDEMINAS. Como principais atividades, destacam-se: visitas da Comunidade de Machado e Região; exposição do Acervo em Congressos e Feiras de Ciências; Palestras de Educação Ambiental; Produção e manutenção do acervo; Grupo de estudos; Projetos: Alfabetização Científica; Museu como Ferramenta na Educação Ambiental e Levantamento de animais vítimas de atropelamento; Parceria do Museu com o Projeto Resgatando Vidas; Convênio com a Superintendência Regional de Ensino para levar o acervo do Museu e palestras a 16 cidades do Sul de Minas.