Das Museum Schleitheimertal zeigt Dauerausstellungen zu den Themen: Geologie, Dorfgeschichte, Kirche und Schulwesen, Volkskunde, Handwerk, Strassenbahn Schaffhausen – Schleitheim (StSS). Ebenso zu sehen ist das Arbeitszimmer des Dichters Anton Pletscher (1827-1916). Von überregionaler Bedeutung sind das Täuferzimmer und die Geschichte des Schweizer Täufertums mit dem Originaldruck des «Schleitheimer Bekenntnis» von 1550. Jährlich gibt es zwei Sonderausstellungen über lokalgeschichtliche Themen oder einheimische Künstlerinnen und Künstler.