Dedicado exclusivamente a mostrar el ámbito, vida y trabajo de los pescadores vascos. Este es uno de los pocos museos en todo el mundo dedicado exclusivamente a mostrar el ámbito, vida y trabajo de los pescadores vascos, describiendo su vida y costumbres, sus organizaciones gremiales, las embarcaciones y las técnicas que han empleado a través del tiempo para la pesca y la comercialización del pescado. También podemos conocer la historia de la Marina de Guerra Auxiliar de Euzkadi, cuyo núcleo principal estuvo formado por pescadores vascos. En 1985, la Diputación Foral de Bizkaia realizó obras destinadas fundamentalmente al arreglo de la cubierta y aprovechamiento de espacios; y entre 1994 y 1995, restauró las fachadas de la Torre. Recientemente se ha restaurado de nuevo el edificio para rescatar su aspecto primitivo, habiéndose remodelado la exposición permanente utilizando las más modernas técnicas expográficas.