Es considerado como uno de los museos más completos de España, se ubica en el palacio renacentista de los Páez de Castillejo. A la importancia de muchas de sus piezas hay que sumar el hecho de que presenta un recorrido arqueológico completo, donde todas las épocas, desde la Prehistoria hasta la Edad Media, están bien representadas. De sus colecciones destacan, entre otras, la Estela de Ategua, ajuares funerarios y una variada muestra de esculturas zoomorfas. El mayor y más variado grupo de piezas es el dedicado a la cultura romana, con importantes testimonios de lo que supuso la capital de la Bética como foco político y cultural de primer orden. La planta alta está dedicada a la colección de piezas medievales, en su mayor parte islámica, destacando la llamada Botella de los Músicos, la colección de brocales de pozo, los tesorillos de monedas, el cervatillo de bronce y el conjunto de capiteles y basas epigrafiadas. El museo se encuentra actualmente en un profundo proceso de cambio debido al proyecto de ampliación y reforma puesto en marcha.