L'édifice réunit deux musées : Le musée d'histoire de Lyon : grâce à une approche synthétique, allant de la capitale des Gaules au 21e siècle, le musée d'histoire de Lyon est un lieu ressource pour cerner la ville, dans toutes ses composantes : urbanistiques, économiques, sociales, politiques, culturelles… S'appuyant sur les 80 000 objets de sa collection et sur des opérations conduites avec les acteurs associatifs, sociaux, éducatifs ou scientifiques de la ville, il offre aux Lyonnais un espace de compréhension de leur environnement quotidien. Il constitue pour ceux qui découvrent Lyon, un point de départ pour leur exploration de la ville. Le musée des marionnettes du monde : il détient une collection de plus de 2 000 marionnettes du monde entier et plus d'un millier de décors, castelets, costumes, accessoires, affiches, programmes et manuscrits. Des archives de spectacles filmés et des diaporamas didactiques accompagnent la présentation des collections. Le musée accueille également des marionnettistes contemporains dans le petit théâtre de Gadagne ou sur son audioguide.