O acervo é formado por mais de 4 mil exemplares de minerais e rochas do Rio Grande do Sul, exemplares da fauna sul-rio-grandense e cerca de 130 mil insetos. O acervo etnológico é representado por artesanatos, fotografias da cultura indígena do Mato Grosso, material lítico e cerâmicas da região sul do Brasil. Foi fundado em 1908, pelo pesquisador Pe. Pio Buck, que iniciou a coleção de entomologia, minerais, fósseis, ictiologia e de ornitologia. Hoje, a bióloga museóloga Alana Cioato é a responsável pelo Museu, e conta com uma equipe formada pela bióloga monitora Luísa Menezes da Silveira.