O nosso atual Museu foi inaugurado em 1994, graças a recursos do programa PADCT do MEC. Ele começou apenas como um centro de visitação para as escolas da rede de ensino de Presidente Prudente e região. É o único local de divulgação científica num raio de 100 km ao nosso redor, abrangendo centenas de cidades do Oeste Paulista.
Após anos atendendo as escolas, incluímos um Telescópio Cassegrain de 20", o que nos permitiu expandir nossas atividades através de minicursos de Astronomia e montar o telescópio em praças e parques da cidade, numa atividade denominada Noites de Observação. Em condições normais, o Centro de Ciências (agora denominado Museu Universitário) recebe uma média de 5.000 alunos da rede de ensino.
Nossa última aquisição, a ser incorporada ao Centro de Ciências, é um planetário móvel para até 35 pessoas, que está sendo utilizado nas escolas estaduais e municipais de Presidente Prudente. Para dar acesso às escolas de cidades distantes de Presidente Prudente, foi criada uma atividade específica denominada Show da Física, onde, numa representação teatral, são mostrados diferentes experimentos de ciências para os estudantes das escolas.
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